учениц составляло сто двадцать человек. 22 июля 1854 года Указом императора  Александра II училище было переименовано в Тобольскую Мариинскую женскую школу  и вошло в состав  ведомства учреждений императрицы Марии и стала пользоваться правами институтов этого ведомства. Школу разместили в специально купленном для нее местным купечеством двухэтажном каменном доме рядом с Михаило-Архангельской церковью. Структура школы состояла из двух отделений: первое, для обучения девиц из низших сословий, в количестве сто двадцати учениц и второе для обучения дочерей благородного сословия, купцов и духовенства, в составе пятидесяти учениц. Отделения делились на два класса: низший и высший, с трёх летними курсами обучения в каждом из классов. На первое отделение принимались девушки с десяти до двенадцати лет, на второе отделение: низший класс — с десяти до двенадцати лет, высший класс — до тринадцати лет. Общей работой Мариинской женской школы занимались два совета школы: попечительский и педагогический. Общим управлением школой ведал Совет школы, подчинённый Западно-Сибирскому генерал-губернатору, первым председателем этого Совета являлся губернатор В. А. Арцимович, а первой попечительницей стала его жена А. Н. Жемчужникова.

       30 августа 1855 года в Мариинской женской школе второе отделение было отнесено ко II разряду, а первое отделение к III разряду. В первом отделении изучались такие предметы как: начало арифметики, чистописание, чтение, Закон Божий, ремесло и рукоделие. Во втором отделении изучались такие предметы как: русский язык, арифметика, чистописание, география России, история, Закон Божий, домашнее хозяйство и рукоделие. В последующем в школе были введены: география, всеобщая история, французский язык, танцы и рисование. 1 июля 1858 года в составе школы был открыт Александровский детский приют, для приёма сирот для обучения в первом отделении.  5 ноября  1859 года генерал-губернатором  Г. Х. Гасфордом было утверждено Положение по которому в Мариинской женской школе, первое отделение было приравнено к курсу обучения уездных училищ, а второе отделение было приближено к гимназическому курсу обучения. 7 февраля 1860 года во втором отделении школы были открыты три класса (низший, средний и высший) с двухгодичными курсами обучения. По окончании полного курса школы выпускницы получали свидетельство учительниц женских 2-х разрядных и сельских училищ, а так же женских прогимназий.

       Большое значение в Мариинской женской школе придавали музыкальному образованию как важной части художественно-эстетического образования, что было характерно для женского образования в дореволюционной России. В середине XIX - начале XX в. музыкальное образование в женских учебных заведениях получило значительное развитие: увеличилось число воспитанниц, обучающихся музыке, расширилась база учебного процесса. В некоторых учебных заведениях были найдены интересные решения методических и организационных проблем обучения музыке. В женских гимназиях и училищах музыкальное образование осуществлялось на основе идей и установок, изложенных в «Наставлении для образования воспитанниц женских учебных заведений», а также в циркулярных предписаниях, инструкциях и методических материалах Мариинского ведомства. Сведения о наличии единой, утвержденной министерством программы отсутствуют. Давались лишь рекомендации попечителям учебных округов уделять внимание музыкальному образованию, чаще всего преподаватели музыки сами разрабатывали программу. Такая программа обычно включала «разучивание общеупотребительных молитв и школьных песен, сообщение элементарных сведений из нотной грамоты».Поскольку музыка или пение отсутствовали в перечне изучаемых дисциплин, основной формой работы была организация хора. В Тобольской Мариинской женской школе существовал общий ученический хор, без выступлений которого не обходилось ни одно знаменательное событие: хор пел на выпускных вечерах, на официальных встречах высокопоставленных гостей, на литературно-художественных праздниках. Особое внимание к хору было связано и с необходимостью его участия в богослужениях. В репертуаре хора были не столько песнопения церковных служб, сколько народные песни, произведения русских и зарубежных композиторов, в том числе и оперные. Нередко хор Мариинской школы объединялся с хором мужской гимназии для выступления на общих вечерах и городских мероприятиях. Объединенный хор исполнял музыку, написанную для смешанного состава голосов, например, финал оперы «Жизнь за царя» М. Глинки, хор поселян из оперы «Князь Игорь» А. Бородина.

       В учебном заведении осуществлялось индивидуальное обучение детей игре на музыкальных инструментах: фортепиано, гитаре. Уроки для желающих проводились на платной основе, так как отсутствовали специальные помещения и было недостаточным количество инструментов.

       3 сентября 1867 года здание второго отделения школы после пожара в Тобольске полностью выгорело и с позволения императрицы Марии Александровны, Четвёртым отделением Собственной Его Императорского Величества канцелярии с 1867 по 1871 год было

выделено 22000 рублей на ремонт зданий школы. 24 июля 1868 года школу посетил великий князь Владимир Александрович, в честь этого посещения в школе была учреждена стипендия его имени. 

      1 июня 1873 года школу посетил великий князь Александр Александрович, будущий император Александр III.

       Со временем старое здание стало тесное для школы и вместо него на этом участке летом 1910 г. состоялась закладка нового учебного комплекса. Накануне окончания строительства 1 августа 1913 г. школа официально была объявлена Мариинской женской семилетней гимназией. Строительными работами руководил губернский архитектор, инженер Леопольд Иванович Шокальский. Используя типовой проект, он же вносил изменения в планировку сооружения и корректировал фасады.

       Учебный корпус представлял собой трехэтажное на полуподвале кирпичное здание с планом в форме «глаголя», развернутое вдоль улицы и замыкающее боковым открылком часть двора.

         Внутри гимназии – просторные светлые классы, широкие коридоры с плоскими потолками и лестницы.

         Кирпичный двухэтажный флигель в глубине двора перекликается с главным корпусом общностью художественных приемов.

           В 1919 году был осуществлён последний выпуск школы и после установления советской власти она была закрыта. На базе Мариинской школы была создана Тобольская школа второй ступени №1, которая  по сей день ведет свою работу по обучению ребят города Тобольска.